研究报告

水稻抗白叶枯病基因 Xa23 启动子变异及功能标记  

张丹丹 , 范玉龙 , 纪向云 , 夏志辉*
海南大学热带作物学院, 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2020年05月18日    接受日期: 2020年05月25日    发表日期: 2020年12月09日
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摘要

Xa23 是广谱强效的水稻抗白叶枯病显性基因,其与等位感病基因 xa23 功能差异在于启动子上的被水稻白叶枯病菌无毒效应因子 avrXa23 能识别激活 28 bp 核心序列(EBEavrXa23),开发其功能标记能够加快水稻育种进程。本研究检测 43 份国外野生稻、7 份代表性常规稻的 Xa23 启动子,利用生物信息软件 Vector NTI 对启动子上游 200 bp 序列进行分析。结果表明,只有 9 份普通野生稻,2 份常规稻能扩增出启动子上游约 200 bp 序列,检出率只有 22.0%,说明 Xa23 不广泛存在于水稻中;进一步的序列分析显示,EBEavrXa23 序列存在丰富的变异,其等位序列至少存在 7 种单倍型,但 EBEavrXa23 只存在水稻 CBB23 中。最后,依据 EBEavrXa23序列开发了 Xa23 显性功能标记,经验证该标记能明确区分水稻是否携 Xa23 基因。本研究将有助于进一步研究 Xa23 进化机制及分子标记辅助选择育种。
 

关键词
水稻白叶枯病;Xa23 启动子;序列分析;EBEavrXa23;分子标记

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《分子植物育种》印刷版
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